法国首相黎世留先与瑞典议和，商定发动战争后任何一方不单独与哈布斯堡皇帝议和，然后于1635年5月对西班牙宣战。战场主要仍在德国境内，但战争同时也在西班牙、西属尼德兰、意大利等地进行。战争开始后，双方蹂躏所占领的对方地区，掠夺和杀戮居民。法军采取多点进攻和破袭交通等手段疲惫对方。1645年孔代亲王协同H·杜伦尼元帅在诺德林根(德境)打败德皇军队。法国和瑞典军队还取得其他几次战争的胜利，使哈布斯堡王朝集团无力再战。瑞典军的节节胜利，引起丹麦王的嫉妒和恐惧，乘瑞典军深入南德时期，丹麦对瑞典宣战。经3年(1643—1645年)战争，瑞典从海陆两路围逼丹麦，丹麦被迫求和。从1643年起，交战双方在威斯特伐利亚开始谈判，一直到1648年10月才达成协议，缔结了两个和约——《奥斯纳布吕条约》和《明斯特和约》(两个和约又统称为《威斯特伐利亚和约》)，至此战争结束。
30年战争，结束了自中世纪以来“一个教皇、一个皇帝”统治欧洲的局面，德国分裂为近300个独立的大小不同的诸侯领地和100多个独立的骑士领土，皇帝企图在欧洲恢复天主教地位完全破灭，神圣罗马帝国在事实上已不复存在。
与此同时，由于德国是30年战争的主战场，生产力遭到严重破坏，六分之五的乡村被毁灭;捷克和萨克森的矿山全部被破坏;人口减少三分之一以上，捷克居民在战前有300万，战后只剩78万人;工商业急剧衰退。绝大多数城市都失去了原先的商业，而沦为诸侯的统治中心。恩格斯说：“在整整一个世纪里，德意志为历史上空前未有的最无纪律的暴兵纵横反复地蹂躏着。到处是焚烧、抢掠、鞭打、强奸、屠杀。大军之外，还有小股的义勇兵，其实，倒不如干脆把他们叫做土匪，他们随随便便，自由行动——凡属有这样匪军出现的地方，农民是最倒霉的了。物质的破坏，人口的凋零，是无穷无尽的。当和平到来的时候，德国已经不可救药了，已经被踏碎、被撕破、遍身流血，躺倒地下了;最可怜的，当然还是农民们。”
西班牙失去了一等强国的地位。战胜国法国从这一次战争中得到了德国大片领土，包括在1552年占领的梅斯、土尔、凡尔登等洛林土地得以承认，阿萨斯和下阿尔萨斯以及西南德意志的一些地区。法国因此成了欧洲霸主。
战胜国瑞典也得到了波罗的海沿岸的大片土地，包括整个西波美拉尼亚，包括鲁根岛在内;还获得了东波美拉尼亚的一些地区和城市，含出海口城市施台廷及奥德河口地区。瑞典国王还以帝国采邑(从皇帝那儿获得的封地)名义获得威塞尔河口及其他一些地区。这样，瑞典不仅据有德意志北部各重要河口，而且由于成了德意志的诸侯，可以随时干涉德意志的内部事务。此外，瑞典还得到500万杜卡登(当时的一种金币)的赔款。瑞典因此成为北欧强国。
和约正式承认荷兰独立;正式承认瑞士脱离神圣罗马帝国，成为独立国。
在宗教方面，和约规定卡尔文教徒享受与路德教徒同样的权利。教会财产的归属以1624年初持有的情况为准。新教得以承认，在帝国法庭中，天主教和新教的法官各占有相等的人数。
这次战争对世界军事学术和技术起了积极的推动作用。
比如：滑膛枪得以进一步改进，并开始大量投入使用;火炮也进行了改进，开始实行标准化;炮兵已成为一个独立兵种;武器装备的改进使战术发生了革命，战斗队形趋向灵活;促使了许多国家军事制度发生变革;在战争中涌现了一大批军事将领，如瑞典的古斯道夫二世、法国的蒂雷纳等。