公元前36年，屋大维肃清了庞培之子小庞培在西西里和撒丁尼亚的势力，又解除了雷必达的军权，只为他保留大教长的虚衔，二头鼎立遂变成两雄对峙。安东尼继承了恺撒的弱点，在东方步恺撒后尘，正式与克列奥帕特拉结婚，迷恋姿色，宣称要把他治下的领土赐予克列奥帕特拉之子，这些丑闻为屋大维反对安东尼提供了最好的炮弹。公元前32年三头分治协议5年期满之时，遂变成屋大维和安东尼公开决裂的起点。屋大维以武力迫使亲安东尼的两位执政官和300名元老东逃，并让元老院和公民大会宣布安东尼为“祖国之敌”，向埃及女王宣战。罗马内战的第二阶段正式开始。
公元前31年9月，屋大维与安东尼大战于希腊的阿克兴海角。此役双方旗鼓相当，交战初期胜负难分，但督战的克列奥帕特拉却在战斗最激烈时率埃及舰队撤退回国，安东尼跟踪而去，全军遂告瓦解。阿克兴的胜利奠定了屋大维主宰帝国全境的权势，成为恺撒事业的真正继承人。公元前30年夏，屋大维进军埃及，包围亚历山大里亚，安东尼伏剑自刎，克列奥帕特拉被俘后仍想施展故技迷惑屋大维，但屋大维作为恺撒的继承人并未继承恺撒迷恋美色的弱点，克列奥帕特拉悲叹自己“无用武之地”，只好自杀。托勒密王朝灭亡，埃及被并入罗马。公元前27年，屋大维获得元老院赠予的“奥古斯都”
尊号，从此以罗马帝国的诞生结束了晚期罗马共和国的内战。
罗马内战揭开了罗马历史新的一页，使罗马奴隶制从共和发展到帝制的新阶段。这次内战对于推动军事学术的发展起了很大的作用。特别是尤利乌斯·恺撒将罗马军事艺术推向巅蜂。恺撒是罗马最杰出的军事家和统帅，他善于根据政治、经济和军事的不同形势来指导战争，在解决重大的战略问题时具有远见卓识。他和他的继承者屋大维在战略上有一个共同特点，那就是具有敏锐的政治头脑，能从政治的全局高度把握军事问题，实现了政治目标同军事手段的完美结合。
在战略战术方面，恺撒善于选择主要突击方向，巧妙地分割敌军，将其各个击破。
他在迅猛、大胆、机动地迎击敌军时，通常集中兵力狠狠打击敌人某一侧翼;在战斗队形中通常留有强大的预备队。预备队作为战斗队形的重要组成部分，用来加强部队在主要方向上的突击力量、实施决战和扩张战果，这是军事学术史上的创举。